Гаалийн тусгай бүсийн нэг үйл ажиллагаа нь агуулахын буюу хадгалалтын аж ахуй бөгөөд хүнс, өргөн хэрэглээний барааны агуулах хадгалалтын тусгай нөхцөл шаардсан химийн бодис болон тэсэрч дэлбэрэх зүйлсийн агуулахын үйлчилгээг үзүүлж байна. Агуулахад тусгай тоног төхөөрөмжөөр бүрэн тоноглогдсон гаалийн үзлэг шалгалт явуулах нөхцлөөр хангагдсан бөгөөд үйлчлүүлэгчдийн бараа, бүтээгдэхүүний онцлогоос хамааран төрөлжсөн агуулахад үнийн хөнгөлөлттэй нөхцлөөр хадгална. Бараа бүтээгдэхүүнийг төрөлжүүлэн ангилж, хураан хадгалахаас гадна ариутгал, хортон шавьж устгалыг технологийн дагуу тодорхой хугацаанд хийж гүйцэтгэдэнэ.